29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3042 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3042  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2409  hypothetical protein  91.21 
 
 		 286 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3312  hypothetical protein  80.74 
 
 		 290 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0618924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3545  hypothetical protein  82.51 
 
 		 288 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2446  hypothetical protein  74.81 
 
 		 296 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.33058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4750  hypothetical protein  74.14 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.838034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1428  hypothetical protein  65.36 
 
 		 295 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4720  hypothetical protein  41.61 
 
 		 288 aa  215  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5187  hypothetical protein  41.61 
 
 		 288 aa  215  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6683  hypothetical protein  40.59 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1867  hypothetical protein  44.13 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5259  protein of unknown function DUF1849  42.51 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1346  hypothetical protein  40 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7421  hypothetical protein  39.02 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1791  hypothetical protein  41.15 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.294448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1124  hypothetical protein  35.63 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2529  hypothetical protein  35.23 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1775  hypothetical protein  36.15 
 
 		 278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3794  hypothetical protein  35.58 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1578  hypothetical protein  36.19 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767865  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0094929  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.619187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1380  hypothetical protein  29.5 
 
 		 278 aa  131  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0582  hypothetical protein  31.6 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104699  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2808  hypothetical protein  26.52 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  0.727732 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0449  Domain of unknown function DUF1849  26.38 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2069  hypothetical protein  25.78 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0157  hypothetical protein  24.08 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>