22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4329 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4329  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4017  hypothetical protein  89.77 
 
 		 88 aa  158  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2702  hypothetical protein  82.95 
 
 		 88 aa  146  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0227124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1241  hypothetical protein  79.76 
 
 		 87 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2379  hypothetical protein  79.55 
 
 		 88 aa  140  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.630868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1126  hypothetical protein  78.57 
 
 		 87 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1259  hypothetical protein  76.19 
 
 		 87 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1756  hypothetical protein  53.57 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.886984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0685  hypothetical protein  55.42 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3986  hypothetical protein  56.96 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00087868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0756  hypothetical protein  50.7 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1478  hypothetical protein  47.76 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4301  hypothetical protein  58.57 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.368926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4819  hypothetical protein  58.57 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  0.27545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4670  hypothetical protein  58.57 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_004310  BR0670  hypothetical protein  32.86 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0663  hypothetical protein  32.86 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1464  hypothetical protein  39.44 
 
 		 85 aa  47.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2616  hypothetical protein  31.43 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363218  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1015  hypothetical protein  36.62 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737954  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1167  hypothetical protein  35.21 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0708  hypothetical protein  36.62 
 
 		 89 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>