31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3913 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3913  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1486  hypothetical protein  72.41 
 
 		 95 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3343  hypothetical protein  71.26 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0429346  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7428  hypothetical protein  65.93 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2328  hypothetical protein  65.17 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1038  hypothetical protein  60.87 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0983054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3549  hypothetical protein  65.12 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.242285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0129  hypothetical protein  56.96 
 
 		 87 aa  98.6  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280117  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1980  hypothetical protein  57.14 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3367  hypothetical protein  57.89 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3813  hypothetical protein  57.69 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1811  hypothetical protein  54.65 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3680  hypothetical protein  59.74 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2794  hypothetical protein  53.01 
 
 		 87 aa  94.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.617961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0762  hypothetical protein  55.13 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0844  hypothetical protein  53.16 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0367  hypothetical protein  57.14 
 
 		 87 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1208  hypothetical protein  54.55 
 
 		 86 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3527  hypothetical protein  54.55 
 
 		 86 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239043  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2865  hypothetical protein  54.43 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.064843  normal  0.0210484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0578  hypothetical protein  55.26 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0767023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3180  hypothetical protein  51.32 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0603995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3019  hypothetical protein  49.35 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0713  hypothetical protein  51.25 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3072  hypothetical protein  50.63 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4018  hypothetical protein  52.56 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835397  normal  0.0668593 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3172  hypothetical protein  47.67 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0527  hypothetical protein  51.28 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.631272  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1516  hypothetical protein  48.24 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.184159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7726  hypothetical protein  51.32 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0513086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3836  hypothetical protein  45 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.071209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>