13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3582 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3582  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2884  hypothetical protein  45.27 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.218946  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4923  hypothetical protein  41.67 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3317  hypothetical protein  41.29 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0327  hypothetical protein  40.59 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2068  hypothetical protein  40.59 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38348  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3468  hypothetical protein  40 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.671623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2903  hypothetical protein  39.8 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1408  hypothetical protein  29.76 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  0.630193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2536  hypothetical protein  25.77 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0484  hypothetical protein  25.87 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.173769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0328  hypothetical protein  29.5 
 
 		 235 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2067  hypothetical protein  29.5 
 
 		 235 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0220632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>