11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3468 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3468  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.671623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3317  hypothetical protein  36.82 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2884  hypothetical protein  36.5 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.218946  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4923  hypothetical protein  39 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0327  hypothetical protein  38 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2068  hypothetical protein  38 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38348  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2903  hypothetical protein  37.13 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2536  hypothetical protein  34.83 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3582  hypothetical protein  39.5 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1408  hypothetical protein  31.22 
 
 		 232 aa  84.3  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  0.630193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0484  hypothetical protein  29.63 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.173769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>