29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3312 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3312  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0618924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2409  hypothetical protein  76.66 
 
 		 286 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3042  hypothetical protein  80.74 
 
 		 273 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3545  hypothetical protein  75.45 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2446  hypothetical protein  70.85 
 
 		 296 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.33058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4750  hypothetical protein  77.39 
 
 		 285 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.838034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1428  hypothetical protein  66.67 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5187  hypothetical protein  44.53 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4720  hypothetical protein  44.53 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1867  hypothetical protein  46.03 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1346  hypothetical protein  42.57 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5259  protein of unknown function DUF1849  43.55 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1791  hypothetical protein  42.8 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.294448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6683  hypothetical protein  40.86 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7421  hypothetical protein  41.13 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3794  hypothetical protein  37.46 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1124  hypothetical protein  35.82 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1578  hypothetical protein  35.29 
 
 		 278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767865  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1775  hypothetical protein  34.9 
 
 		 278 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2028  hypothetical protein  34.48 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0094929  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2529  hypothetical protein  35.06 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1121  hypothetical protein  33.6 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.619187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1164  hypothetical protein  33.6 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1380  hypothetical protein  32.29 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0582  hypothetical protein  29.7 
 
 		 271 aa  125  9e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104699  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2808  hypothetical protein  25.58 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  0.727732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2069  hypothetical protein  25.98 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0449  Domain of unknown function DUF1849  27.95 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0157  hypothetical protein  23.11 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>