21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1916 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1916  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 322 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0480  von Willebrand factor type A  50.93 
 
 		 342 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4509  von Willebrand factor type A  58.92 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.720482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4623  von Willebrand factor type A  59.41 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22995  normal  0.878919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4141  von Willebrand factor type A  58.92 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4201  von Willebrand factor type A  55.19 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564539  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8031  von Willebrand factor type A  51.93 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0788  MxaL protein, putative  52.12 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.169917  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3002  von Willebrand factor, type A  48.54 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2035  MxaL protein, putative  37.96 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4028  putative MxaL-like protein  40.64 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17942  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2416  putative MxaL-like protein  37.17 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3273  MxaL protein, putative  35.51 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1530  MxaL protein, putative  37.24 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.766517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3806  putative MxaL-like protein  33.65 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3052  MxaL protein, putative  33.86 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1820  hypothetical protein  40.74 
 
 		 364 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1891  MxaL protein, putative  41.63 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0692  von Willebrand factor, type A  34.4 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1900  von Willebrand factor, type A  28.83 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  26.4 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>