20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3530 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3530  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.299759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1935  hypothetical protein  93.7 
 
 		 127 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2046  hypothetical protein  71.65 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1767  hypothetical protein  62.2 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0579  hypothetical protein  43.85 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0715642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0563  hypothetical protein  44.09 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0562  hypothetical protein  44.09 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2694  hypothetical protein  39.26 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1635  hypothetical protein  39.68 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.959214  normal  0.217031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2931  hypothetical protein  41.54 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4925  hypothetical protein  39.37 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.229271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4209  hypothetical protein  37.69 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4722  hypothetical protein  36.15 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160969  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4416  hypothetical protein  39.84 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  0.635789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4879  hypothetical protein  39.06 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.495712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1202  hypothetical protein  38.76 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0937  hypothetical protein  34.62 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1666  hypothetical protein  41.27 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0824  hypothetical protein  39.23 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3312  hypothetical protein  29.85 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>