25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2801 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2801  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2832  hypothetical protein  68.63 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0471494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3240  hypothetical protein  62.93 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1114  hypothetical protein  60.98 
 
 		 111 aa  90.9  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.10293  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2935  hypothetical protein  45.79 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3037  hypothetical protein  51.81 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2463  hypothetical protein  52.34 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.042931  normal  0.181289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2115  hypothetical protein  55.38 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4117  hypothetical protein  44.21 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690981  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5850  hypothetical protein  40.22 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.980958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2201  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2504  hypothetical protein  54.24 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3817  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5198  hypothetical protein  39.77 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0432  hypothetical protein  52.38 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3723  hypothetical protein  50.82 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4631  hypothetical protein  49.25 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0537767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4264  hypothetical protein  47.76 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1530  hypothetical protein  42.68 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.010116  normal  0.139941 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4549  hypothetical protein  42.42 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5556  hypothetical protein  43.28 
 
 		 108 aa  50.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563792  hitchhiker  0.000681675 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4309  hypothetical protein  40.91 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3741  hypothetical protein  45.71 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5643  hypothetical protein  41.38 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.495939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3681  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>