14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2702 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2702  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607295  normal  0.209698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2744  hypothetical protein  87.62 
 
 		 105 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3143  hypothetical protein  79.05 
 
 		 107 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2747  hypothetical protein  75.26 
 
 		 109 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.609835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2903  hypothetical protein  49.47 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2891  hypothetical protein  42.99 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0384  hypothetical protein  36.54 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1573  hypothetical protein  36.54 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725084  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2860  hypothetical protein  38.14 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0956  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3731  hypothetical protein  31.71 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.351793  normal  0.0833694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3766  hypothetical protein  31.71 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.487018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3658  hypothetical protein  31.71 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>