11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2593 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2593  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  272  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0514381  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2867  hypothetical protein  71.97 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246248  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2422  hypothetical protein  42.62 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0767642  normal  0.0624133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3280  hypothetical protein  46.21 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1869  hypothetical protein  42.28 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.127244  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2202  hypothetical protein  39.52 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.292347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3717  hypothetical protein  40.48 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21489  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2901  hypothetical protein  37.7 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.703221  normal  0.0446482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4538  hypothetical protein  35.61 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2317  hypothetical protein  36.96 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1026  hypothetical protein  34.38 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>