29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2409 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2409  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3042  hypothetical protein  91.21 
 
 		 273 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3545  hypothetical protein  78.32 
 
 		 288 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3312  hypothetical protein  76.66 
 
 		 290 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0618924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2446  hypothetical protein  73.68 
 
 		 296 aa  411  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.33058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4750  hypothetical protein  71.48 
 
 		 285 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.838034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1428  hypothetical protein  65.71 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4720  hypothetical protein  41.04 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5187  hypothetical protein  41.04 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5259  protein of unknown function DUF1849  43.32 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1346  hypothetical protein  39.69 
 
 		 302 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1867  hypothetical protein  43.72 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1791  hypothetical protein  39.36 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.294448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6683  hypothetical protein  38.97 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7421  hypothetical protein  38.64 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3794  hypothetical protein  35.58 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1124  hypothetical protein  32.62 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2529  hypothetical protein  33.21 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1775  hypothetical protein  36.4 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2028  hypothetical protein  33.84 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0094929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1578  hypothetical protein  34.54 
 
 		 278 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767865  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1121  hypothetical protein  32.85 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.619187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1164  hypothetical protein  32.85 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1380  hypothetical protein  29.12 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0582  hypothetical protein  29.21 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104699  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2808  hypothetical protein  26.69 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  0.727732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2069  hypothetical protein  24.59 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0449  Domain of unknown function DUF1849  26.56 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0157  hypothetical protein  25.2 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>