16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1814 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1814  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1313  hypothetical protein  71.31 
 
 		 249 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4749  hypothetical protein  66.24 
 
 		 246 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4145  hypothetical protein  59.65 
 
 		 252 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3510  hypothetical protein  55.37 
 
 		 247 aa  269  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.26644  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2715  hypothetical protein  54.46 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6879  hypothetical protein  54.93 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0994967  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2809  hypothetical protein  42.44 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555734  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3370  hypothetical protein  36.94 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1382  hypothetical protein  36.94 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.42725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3672  hypothetical protein  36.04 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311536 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0976  hypothetical protein  36.76 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0915  hypothetical protein  35.89 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2380  hypothetical protein  26.9 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0858  hypothetical protein  30.22 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0399112  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3433  hypothetical protein  27.17 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>