11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1667 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1667  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1017    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0364929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4068  6-hydroxynicotinate reductase  60.96 
 
 		 526 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0353836  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2425  6-hydroxynicotinate reductase  77.39 
 
 		 482 aa  737    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4211  hypothetical protein  77.85 
 
 		 501 aa  764    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.337138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1984  hypothetical protein  66.87 
 
 		 505 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1248  hypothetical protein  63.98 
 
 		 502 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101544  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4323  hypothetical protein  61.08 
 
 		 542 aa  628  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0654  6-hydroxynicotinate reductase  60.96 
 
 		 543 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0853  hypothetical protein  62.58 
 
 		 550 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0178  6-hydroxynicotinate reductase  62.28 
 
 		 538 aa  604  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2148  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.7 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>