14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5078 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_5078  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  352  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5529  hypothetical protein  97.11 
 
 		 201 aa  344  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5271  hypothetical protein  71.01 
 
 		 175 aa  253  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5363  hypothetical protein  71.01 
 
 		 175 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5142  hypothetical protein  71.6 
 
 		 175 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5413  hypothetical protein  72.22 
 
 		 175 aa  249  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911887  normal  0.141138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5664  hypothetical protein  63.92 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.821811  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4557  hypothetical protein  50.61 
 
 		 197 aa  179  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04350  hypothetical protein  42.59 
 
 		 176 aa  143  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3569  hypothetical protein  35.15 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0398  hypothetical protein  31.29 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4187  hypothetical protein  31.87 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.431269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2072  hypothetical protein  28.07 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0524  hypothetical protein  25.57 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>