19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4921 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4921  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  64 
 
 
323 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  64.8 
 
 
323 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  49.59 
 
 
364 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  49.6 
 
 
321 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  45.83 
 
 
541 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  48.36 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  48.36 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  46.15 
 
 
567 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  46.15 
 
 
567 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  46.15 
 
 
567 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  40.5 
 
 
551 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  40.98 
 
 
543 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  41.88 
 
 
565 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  43.44 
 
 
360 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  41.73 
 
 
231 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  40.65 
 
 
232 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1305  hypothetical protein  43.86 
 
 
58 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  39.66 
 
 
178 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>