16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4920 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4920  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  400  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  66.33 
 
 
323 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  65.31 
 
 
323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  30.54 
 
 
543 aa  95.9  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  31.5 
 
 
565 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  34 
 
 
321 aa  91.7  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  32.34 
 
 
567 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  32.34 
 
 
567 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  32.34 
 
 
567 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  28.81 
 
 
364 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  32.64 
 
 
551 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  35.54 
 
 
359 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  35.54 
 
 
359 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  31.67 
 
 
360 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  29.03 
 
 
541 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>