22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4588 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4588  Phage GP46  100 
 
 		 132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1161  Phage FluMu protein gp46  61.36 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2252  phage protein GP46  48.28 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4480  phage protein GP46  48.28 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2249  phage protein GP46  48.28 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3861  phage FluMu protein gp46  49.61 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2734  phage protein GP46  52.53 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.86914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2585  phage GP46 family protein  44.64 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1472  phage protein GP46  51.52 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2812  GP46 family protein  51.52 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3114  GP46 family protein  51.61 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1045  phage protein GP46  45.61 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3734  phage GP46  53.85 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2085  phage protein GP46  45.69 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3048  putative bacteriophage protein GP46, Mu-like  42.06 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162081 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1871  GP46 family protein  38.84 
 
 		 405 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881976  hitchhiker  0.000000000000640584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2701  hypothetical protein  32.61 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0695  phage protein GP46  41.05 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0742  phage protein GP46  41.05 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6584  putative bacteriophage protein, GP46-like protein  30.58 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2445  hypothetical protein  31.71 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4483  GP46 family protein  34.78 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.185083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>