13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4041 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4041  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222851  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4346  hypothetical protein  85.96 
 
 		 114 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4042  hypothetical protein  63.19 
 
 		 146 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270544  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3185  hypothetical protein  52.54 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4029  hypothetical protein  45.71 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4337  hypothetical protein  45.71 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1361  hypothetical protein  43.1 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1362  hypothetical protein  27.05 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0310  putative periplasmic protein  28.15 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3077  hypothetical protein  29.03 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0304  hypothetical protein  28.57 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.025382  normal  0.0547259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0316  hypothetical protein  28.57 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2425  hypothetical protein  29.03 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>