13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3384 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3384  putative lipoprotein  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3626  lipoprotein, putative  92.59 
 
 		 135 aa  230  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3887  hypothetical protein  58.33 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1549  hypothetical protein  56.94 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3644  hypothetical protein  55.17 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4319  hypothetical protein  56.25 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.860691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1586  hypothetical protein  60 
 
 		 135 aa  153  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2782  hypothetical protein  42.64 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.981039  normal  0.95643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3843  putative lipoprotein  43.44 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45260  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30360  hypothetical protein  40.82 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3121  hypothetical protein  42.37 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310321  normal  0.0170994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1471  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
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