20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2766 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2766  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2094  hypothetical protein  76.57 
 
 		 171 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4036  hypothetical protein  82.67 
 
 		 159 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3932  hypothetical protein  59.12 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.751475  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4095  hypothetical protein  43.64 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1584  hypothetical protein  42.94 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.350086  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1357  hypothetical protein  54.55 
 
 		 168 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364568  normal  0.260682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3359  hypothetical protein  39.16 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3387  hypothetical protein  43.24 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826863  hitchhiker  0.000958811 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2091  protein GP55  30.19 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0071372  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3887  hypothetical protein  44.44 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1097  hypothetical protein  28.57 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926536 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2084  phage-tail assembly-like protein  30.38 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1795  hypothetical protein  36.59 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4458  protein gp55  30.11 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2082  hypothetical protein  31.1 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1435  hypothetical protein  31.1 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  0.312152 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0687  protein gp55  31.1 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2419  hypothetical protein  40.35 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1643  hypothetical protein  30.43 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000036916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>