11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1768 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3707  hypothetical protein  73.68 
 
 
1743 aa  2570    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1768  hypothetical protein  100 
 
 
1742 aa  3545    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2566  hypothetical protein  26.57 
 
 
1609 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.812581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  24.34 
 
 
1565 aa  109  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3453  hypothetical protein  24.71 
 
 
1527 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5111  hypothetical protein  25.1 
 
 
1559 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4883  hypothetical protein  22.55 
 
 
1586 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.718638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5009  hypothetical protein  21.76 
 
 
1586 aa  77.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5060  hypothetical protein  25.68 
 
 
1571 aa  73.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0405  hypothetical protein  23.15 
 
 
1555 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.354945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4933  hypothetical protein  24.86 
 
 
1530 aa  68.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
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