24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1577 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1577  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3908  hypothetical protein  94.8 
 
 		 174 aa  339  9e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1402  hypothetical protein  57.95 
 
 		 180 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4102  hypothetical protein  56.02 
 
 		 173 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1309  hypothetical protein  54.82 
 
 		 173 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000696984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3887  hypothetical protein  53.53 
 
 		 173 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4580  hypothetical protein  55.63 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1785  hypothetical protein  55.75 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0605604  normal  0.726112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4083  hypothetical protein  50.57 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47320  hypothetical protein  49.43 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0542  hypothetical protein  46 
 
 		 173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3642  hypothetical protein  32.73 
 
 		 181 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0214  hypothetical protein  36.59 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2685  hypothetical protein  32.39 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  hitchhiker  0.000194293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3005  hypothetical protein  22.15 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3102  hypothetical protein  21.99 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1102  hypothetical protein  21.48 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1089  hypothetical protein  22.7 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.429336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2923  hypothetical protein  22.46 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1193  hypothetical protein  21.48 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3197  hypothetical protein  21.48 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.367183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02213  hypothetical protein  20.67 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1262  hypothetical protein  23.4 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1161  hypothetical protein  26.92 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>