30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1447 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1447  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0866  hypothetical protein  84.21 
 
 		 121 aa  199  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4510  hypothetical protein  54.76 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59890  hypothetical protein  54.76 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571428  hitchhiker  0.00000000000107847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36230  hypothetical protein  54.62 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2854  hypothetical protein  43.75 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3419  hypothetical protein  44.03 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  0.0716917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1189  hypothetical protein  44.03 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4174  hypothetical protein  44.36 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950155  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1169  hypothetical protein  44.03 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2348  hypothetical protein  44.27 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000206285  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2389  hypothetical protein  45.19 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1261  hypothetical protein  43.51 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1403  hypothetical protein  43.51 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2191  hypothetical protein  46.03 
 
 		 136 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1631  hypothetical protein  43.09 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0953  hypothetical protein  44.62 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0440  hypothetical protein  44.35 
 
 		 132 aa  96.7  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0678  hypothetical protein  46.83 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.450088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3018  hypothetical protein  41.94 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0507  hypothetical protein  48.03 
 
 		 152 aa  87.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2943  hypothetical protein  45.61 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3325  hypothetical protein  46.09 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0332  hypothetical protein  31.67 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.134237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4091  hypothetical protein  31.67 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4174  hypothetical protein  31.67 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1759  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0655  hypothetical protein  29.6 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3710  hypothetical protein  29.75 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3931  hypothetical protein  29.84 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>