18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0233 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0233  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0099  hypothetical protein  92.31 
 
 		 135 aa  228  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5528  hypothetical protein  84.62 
 
 		 117 aa  210  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1487  hypothetical protein  70.94 
 
 		 117 aa  178  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00715013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1508  hypothetical protein  69.23 
 
 		 117 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0198  hypothetical protein  69.23 
 
 		 117 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5324  hypothetical protein  70.09 
 
 		 117 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2168  hypothetical protein  67.52 
 
 		 117 aa  173  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.3114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5182  hypothetical protein  69.23 
 
 		 117 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535352  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4062  hypothetical protein  69.23 
 
 		 117 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5272  hypothetical protein  69.23 
 
 		 117 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0243  hypothetical protein  67.52 
 
 		 117 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2081  hypothetical protein  67.52 
 
 		 117 aa  164  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16980  hypothetical protein  65.81 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.993879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1477  hypothetical protein  65.81 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1338  hypothetical protein  63.25 
 
 		 117 aa  156  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0769021  hitchhiker  0.0000834558 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3013  hypothetical protein  64.1 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1158  hypothetical protein  32.94 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.308257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>