73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0784 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  395  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  94.92 
 
 
197 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  34.92 
 
 
175 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  33.89 
 
 
169 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  34.16 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  36.26 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  33.87 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  30.11 
 
 
172 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  34.81 
 
 
169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  34.81 
 
 
169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  34.81 
 
 
169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  33.52 
 
 
169 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  36.26 
 
 
169 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  35.48 
 
 
169 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  35.48 
 
 
169 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  33.16 
 
 
212 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  32.97 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  35 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  35.48 
 
 
169 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  34.25 
 
 
169 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  35.16 
 
 
169 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  32.77 
 
 
177 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  31.84 
 
 
185 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  35.48 
 
 
169 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  32.24 
 
 
176 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  34.43 
 
 
169 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  33.7 
 
 
168 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  42.59 
 
 
210 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  29.51 
 
 
174 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  32.6 
 
 
167 aa  100  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  33.16 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  31.89 
 
 
198 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  32.6 
 
 
169 aa  99.4  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  33.53 
 
 
163 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  34.86 
 
 
159 aa  98.6  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  31.55 
 
 
179 aa  98.2  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  32.22 
 
 
168 aa  97.8  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  31.87 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  31.77 
 
 
177 aa  91.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  42.45 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  41.18 
 
 
179 aa  88.6  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  32.62 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  37.61 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  42 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  31.4 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  32.46 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  30.54 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  29.28 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  27.89 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  31.71 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  38.78 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  26.63 
 
 
221 aa  63.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  25.81 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  35 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  36.73 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  36.73 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  32.12 
 
 
163 aa  58.5  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  33 
 
 
163 aa  58.5  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  28.67 
 
 
147 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  28.67 
 
 
147 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  28.67 
 
 
147 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  31.01 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  29.66 
 
 
151 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  32.53 
 
 
167 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  27.46 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  38.71 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  35.29 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  27.86 
 
 
168 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  35.48 
 
 
165 aa  42  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>