13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5270 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5270  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5362  hypothetical protein  96.03 
 
 		 126 aa  248  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.303091  normal  0.949027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5411  hypothetical protein  89.68 
 
 		 126 aa  233  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5140  hypothetical protein  80.19 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5076  hypothetical protein  60.98 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5656  hypothetical protein  66.97 
 
 		 124 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5527  hypothetical protein  60.33 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29230  hypothetical protein  43.24 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73030  hypothetical protein  58.16 
 
 		 138 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6340  hypothetical protein  51.16 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3438  putative signal peptide protein  34.82 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3249  putative signal peptide protein  29.66 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4070  putative signal peptide protein  29.17 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0450708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>