12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4820 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4820  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.793839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1175  hypothetical protein  32.65 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3589  hypothetical protein  28.65 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.348708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0620  hypothetical protein  26.56 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0647  hypothetical protein  26.56 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4278  hypothetical protein  29.07 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3019  hypothetical protein  28.34 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0534  hypothetical protein  27.6 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49810  hypothetical protein  28.25 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4243  hypothetical protein  29.19 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0216  hypothetical protein  25.87 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.636809  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1361  hypothetical protein  26.67 
 
 		 540 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>