18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4814 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4814  Mig-14 family protein  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4942  Mig-14 family protein  98.99 
 
 		 298 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4991  Mig-14 family protein  95.97 
 
 		 298 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0526  Mig-14 family protein  91.61 
 
 		 298 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254564  normal  0.164159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0475  Mig-14  81.08 
 
 		 298 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.496349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0530  Mig-14  72.73 
 
 		 298 aa  454  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0825509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4990  hypothetical protein  72.73 
 
 		 298 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66150  hypothetical protein  73.74 
 
 		 298 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5738  hypothetical protein  72.73 
 
 		 298 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0595  Mig-14 family protein  65.32 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44700  Mig-14 family protein  59.4 
 
 		 298 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.390095  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2958  hypothetical protein  26.83 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127053  hitchhiker  0.0000324409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2893  Mig-14  26.83 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3080  Mig-14  26.83 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2924  Mig-14  26.83 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2977  hypothetical protein  26.48 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0097  Mig-14 family protein  27.3 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028214  hitchhiker  0.0000000164486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1493  Mig-14 family protein  26.21 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.66727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>