44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4670 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  97.51 
 
 		 201 aa  360  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  96.02 
 
 		 201 aa  353  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  86.07 
 
 		 201 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  63.32 
 
 		 201 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  62.81 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  61 
 
 		 201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  56.72 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  53.4 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  54.08 
 
 		 207 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  50.74 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.33 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  26.11 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.71 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  27.33 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  33.33 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 164 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 164 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 164 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  26.9 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  27.16 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  24.36 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  28.38 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  24.32 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  32.35 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  26.35 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  23.78 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  32.32 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2345  hypothetical protein  28.87 
 
 		 164 aa  45.1  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  25.97 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  25.35 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  20.71 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  20.71 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  20.71 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  33.33 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  25.17 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  27.17 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  24.48 
 
 		 165 aa  41.6  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>