49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3490 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3490  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0707746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2248  hypothetical protein  99.44 
 
 		 354 aa  679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.284315  normal  0.730008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1879  hypothetical protein  95.73 
 
 		 357 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2010  hypothetical protein  68.64 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0167  hypothetical protein  55.78 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0308  hypothetical protein  29.31 
 
 		 355 aa  186  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0692  hypothetical protein  28.08 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0235088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0677  hypothetical protein  28.08 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.202663  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1518  hypothetical protein  31.96 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.913415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2592  hypothetical protein  28.44 
 
 		 359 aa  169  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2540  hypothetical protein  28.44 
 
 		 359 aa  169  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12490  uncharacterized membrane protein  36.86 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2232  hypothetical protein  33.53 
 
 		 349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0643  hypothetical protein  34.19 
 
 		 357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1876  hypothetical protein  34.85 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2079  hypothetical protein  28.4 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0857  hypothetical protein  36.36 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.549671  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0471  hypothetical protein  32.09 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05130  uncharacterized membrane protein  36.18 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0081  hypothetical protein  28.78 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00405626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2562  hypothetical protein  27.89 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4945  hypothetical protein  28.9 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000030592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2221  hypothetical protein  30.72 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2884  hypothetical protein  24.86 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3313  hypothetical protein  29.53 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2565  hypothetical protein  24.78 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4359  hypothetical protein  27.17 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21530  uncharacterized membrane protein  25.2 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.198401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07920  uncharacterized membrane protein  31.27 
 
 		 385 aa  115  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1874  hypothetical protein  25.36 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3295  hypothetical protein  25.66 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2014  hypothetical protein  25.66 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.85804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1765  hypothetical protein  29.43 
 
 		 346 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2091  hypothetical protein  25.51 
 
 		 346 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.295909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1840  hypothetical protein  25.22 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.406982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1870  hypothetical protein  25.22 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2046  hypothetical protein  25.22 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00084703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1824  hypothetical protein  25.22 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2012  hypothetical protein  25.22 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2125  hypothetical protein  25.22 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.586239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1519  hypothetical protein  27.09 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25260  uncharacterized membrane protein  24.79 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.461148  normal  0.040821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23450  hypothetical protein  28.12 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0299  hypothetical protein  26.22 
 
 		 356 aa  106  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2710  hypothetical protein  25.15 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0891  hypothetical protein  26.47 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139319  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1661  hypothetical protein  31 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2507  transporter  30.61 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1461  hypothetical protein  24.33 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0143143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>