14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3082 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3082  coenzyme PQQ biosynthesis protein A  100 
 
 		 64 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0380  coenzyme PQQ synthesis protein PqqA  100 
 
 		 23 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1965  coenzyme PQQ synthesis protein PqqA  100 
 
 		 23 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00608845  normal  0.20421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4823  coenzyme PQQ synthesis protein PqqA  95.65 
 
 		 23 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0513  coenzyme PQQ synthesis protein A  95.45 
 
 		 24 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4670  coenzyme PQQ synthesis protein PqqA  95.45 
 
 		 24 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5157  coenzyme PQQ synthesis protein PqqA  95.45 
 
 		 24 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38825  coenzyme PQQ synthesis protein PqqA  82.61 
 
 		 23 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3309  coenzyme PQQ synthesis protein PqqA  82.61 
 
 		 23 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.801941  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0021  coenzyme PQQ biosynthesis protein A  63.33 
 
 		 52 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2488  coenzyme PQQ synthesis protein PqqA  77.27 
 
 		 24 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.080337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2094  coenzyme PQQ synthesis protein PqqA  77.27 
 
 		 24 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0308639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0862  coenzyme PQQ biosynthesis protein A  60.87 
 
 		 23 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0286  coenzyme PQQ biosynthesis protein A  72.73 
 
 		 24 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.616635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>