30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2943 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2943  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3325  hypothetical protein  96.72 
 
 		 133 aa  216  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3018  hypothetical protein  68.5 
 
 		 137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1631  hypothetical protein  48.48 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3419  hypothetical protein  48.85 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  0.0716917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4174  hypothetical protein  48.46 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950155  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0440  hypothetical protein  46.21 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2348  hypothetical protein  47.37 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000206285  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1189  hypothetical protein  47.69 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1169  hypothetical protein  47.33 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1403  hypothetical protein  46.62 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1261  hypothetical protein  46.62 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2191  hypothetical protein  49.61 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2389  hypothetical protein  49.61 
 
 		 136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2854  hypothetical protein  44.62 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0678  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.450088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59890  hypothetical protein  44.92 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571428  hitchhiker  0.00000000000107847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0953  hypothetical protein  48.82 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4510  hypothetical protein  44.92 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0507  hypothetical protein  51.61 
 
 		 152 aa  98.6  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36230  hypothetical protein  42.19 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1447  hypothetical protein  44.63 
 
 		 130 aa  96.7  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0866  hypothetical protein  51.58 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0655  hypothetical protein  41.38 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4174  hypothetical protein  36.89 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0332  hypothetical protein  36.36 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.134237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4091  hypothetical protein  36.36 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3710  hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1759  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3931  hypothetical protein  28.93 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>