27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2048 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2048  ethanolamine utilisation protein, EutH  100 
 
 		 410 aa  810    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3585  ethanolamine utilisation protein, EutH  62.37 
 
 		 398 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2026  Ethanolamine utilization protein EutH  52.63 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.86347  hitchhiker  0.00000329746 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05800  ethanolamine utilization protein  50.87 
 
 		 402 aa  430  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0328304  hitchhiker  0.00312755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45130  putative transporter  48.36 
 
 		 411 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2693  ethanolamine utilisation protein EutH  45.71 
 
 		 415 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000770078  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0902  ethanolamine utilization protein EutH  33.25 
 
 		 365 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.348344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1238  ethanolamine utilisation protein, EutH  31.18 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1218  Ethanolamine utilisation protein EutH  33.51 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1057  Ethanolamine utilisation protein EutH  31.89 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1225  ethanolamine utilisation protein EutH  33.51 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2729  ethanolamine utilization protein EutH  33.51 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2580  ethanolamine utilization protein EutH  33.51 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2635  ethanolamine utilisation protein EutH  35.14 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2598  ethanolamine utilization protein EutH  32.74 
 
 		 408 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3673  ethanolamine utilization protein EutH  34.14 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02305  hypothetical protein  32.98 
 
 		 408 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02343  predicted inner membrane protein  32.98 
 
 		 408 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2818  ethanolamine utilization protein EutH  33.87 
 
 		 408 aa  192  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2694  ethanolamine utilization protein EutH  33.06 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.720736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2605  ethanolamine utilization protein EutH  33.06 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2827  ethanolamine utilization protein EutH  33.06 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2653  ethanolamine utilization protein EutH  32.8 
 
 		 408 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2720  ethanolamine utilization protein EutH  32.8 
 
 		 408 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.29915 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0080  Ethanolamine utilisation protein EutH  30.43 
 
 		 370 aa  179  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2492  putative ethanolamine utilization protein EutH  27.09 
 
 		 374 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2198  ethanolamine utilization protein euth  26.53 
 
 		 363 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.846609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>