13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1549 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1549  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  279  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4319  hypothetical protein  98.55 
 
 		 138 aa  276  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.860691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3887  hypothetical protein  96.38 
 
 		 138 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3644  hypothetical protein  91.37 
 
 		 139 aa  253  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3626  lipoprotein, putative  56.94 
 
 		 135 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1586  hypothetical protein  57.86 
 
 		 135 aa  146  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3384  putative lipoprotein  56.94 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2782  hypothetical protein  44.7 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.981039  normal  0.95643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3843  putative lipoprotein  46.83 
 
 		 137 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45260  hypothetical protein  57.53 
 
 		 144 aa  94  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30360  hypothetical protein  41.94 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1471  hypothetical protein  33.9 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3121  hypothetical protein  38.98 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310321  normal  0.0170994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>