13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5140 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5140  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  256  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5411  hypothetical protein  80.16 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5362  hypothetical protein  79.37 
 
 		 126 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.303091  normal  0.949027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5270  hypothetical protein  76.19 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5656  hypothetical protein  62.07 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5076  hypothetical protein  56.91 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5527  hypothetical protein  55.08 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73030  hypothetical protein  60.2 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6340  hypothetical protein  53.23 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29230  hypothetical protein  45.28 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3438  putative signal peptide protein  29.6 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3249  putative signal peptide protein  29.57 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4070  putative signal peptide protein  26.8 
 
 		 116 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0450708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>