11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4698 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4906  metal-dependent hydrolase HDOD  83.76 
 
 
511 aa  810    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4782  metal-dependent hydrolase HDOD  83.95 
 
 
511 aa  811    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4959  metal-dependent hydrolase HDOD  84.15 
 
 
511 aa  811    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.840319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4698  metal-dependent hydrolase HDOD  100 
 
 
511 aa  1018    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0511  signal transduction protein  61.45 
 
 
512 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0560  hypothetical protein  63.07 
 
 
511 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4954  hypothetical protein  62.48 
 
 
511 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0623  HDOD  52.67 
 
 
507 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5684  HDOD domain-contain protein  54.53 
 
 
503 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65470  hypothetical protein  53.52 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2642  metal-dependent hydrolase HDOD  22.93 
 
 
492 aa  53.5  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.994556  hitchhiker  0.000160222 
 
 
-
 
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