22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3887 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3887  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  348  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4102  hypothetical protein  91.33 
 
 		 173 aa  323  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1309  hypothetical protein  89.6 
 
 		 173 aa  320  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000696984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4580  hypothetical protein  90.17 
 
 		 173 aa  296  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3908  hypothetical protein  53.45 
 
 		 174 aa  205  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1577  hypothetical protein  53.53 
 
 		 174 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1402  hypothetical protein  55.15 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47320  hypothetical protein  47.4 
 
 		 174 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4083  hypothetical protein  47.06 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1785  hypothetical protein  51.72 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0605604  normal  0.726112 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0542  hypothetical protein  41.4 
 
 		 173 aa  147  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2685  hypothetical protein  43.8 
 
 		 195 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  hitchhiker  0.000194293 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3642  hypothetical protein  36.81 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0214  hypothetical protein  38.51 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3005  hypothetical protein  26.19 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3102  hypothetical protein  24.65 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2923  hypothetical protein  24.11 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1089  hypothetical protein  23.12 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.429336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1193  hypothetical protein  23.97 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1262  hypothetical protein  24.85 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1102  hypothetical protein  23.97 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3197  hypothetical protein  23.97 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.367183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>