13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3644 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3644  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1549  hypothetical protein  91.37 
 
 		 138 aa  253  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3887  hypothetical protein  89.93 
 
 		 138 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4319  hypothetical protein  89.93 
 
 		 138 aa  249  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.860691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3626  lipoprotein, putative  55.17 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1586  hypothetical protein  53.96 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3384  putative lipoprotein  55.17 
 
 		 135 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2782  hypothetical protein  45.19 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.981039  normal  0.95643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3843  putative lipoprotein  46.72 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45260  hypothetical protein  57.53 
 
 		 144 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30360  hypothetical protein  41.18 
 
 		 155 aa  67  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3121  hypothetical protein  42.37 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310321  normal  0.0170994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1471  hypothetical protein  30.51 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
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