15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1357 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1357  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364568  normal  0.260682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1584  hypothetical protein  74.85 
 
 
166 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.350086  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3359  hypothetical protein  68.71 
 
 
166 aa  190  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4095  hypothetical protein  66.06 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2094  hypothetical protein  45.7 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4036  hypothetical protein  46.62 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2766  hypothetical protein  53.77 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3932  hypothetical protein  37.18 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.751475  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3887  hypothetical protein  41.44 
 
 
162 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3387  hypothetical protein  37.5 
 
 
177 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826863  hitchhiker  0.000958811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2419  hypothetical protein  34.55 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1795  hypothetical protein  40 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551004  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0687  protein gp55  31.55 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2082  hypothetical protein  30.54 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1435  hypothetical protein  30.36 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  0.312152 
 
 
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