49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0626 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  86.07 
 
 		 201 aa  323  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  85.57 
 
 		 201 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  85.57 
 
 		 201 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  63.82 
 
 		 201 aa  262  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  63.32 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  60.5 
 
 		 201 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  52.97 
 
 		 203 aa  208  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  53.4 
 
 		 208 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  54.08 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  51.23 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  28.3 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.8 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  33.33 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.14 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.17 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  33.33 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  25.32 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  25.32 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  28.76 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  27.16 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  25.62 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 164 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 164 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  34.34 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2345  hypothetical protein  28.28 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26493  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  26.35 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  26.35 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  23.72 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.61 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.61 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.61 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.61 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.61 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  23.72 
 
 		 164 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  24.14 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  30.77 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 164 aa  42  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3004  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.07 
 
 		 193 aa  42  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00131027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0730  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.07 
 
 		 193 aa  42  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  21.25 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  21.25 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  21.25 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>