17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0426 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0426  lipoprotein  100 
 
 		 84 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5038  hypothetical protein  97.26 
 
 		 84 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5088  hypothetical protein  97.26 
 
 		 84 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4912  hypothetical protein  97.26 
 
 		 84 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67460  putative lipoprotein  80.72 
 
 		 85 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0355  putative lipoprotein  83.33 
 
 		 84 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0369  putative lipoprotein  80.95 
 
 		 84 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5841  putative lipoprotein  79.52 
 
 		 85 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5169  lipoprotein, putative  78.57 
 
 		 84 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45630  hypothetical protein  67.06 
 
 		 84 aa  123  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0510  hypothetical protein  77.27 
 
 		 83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2268  hypothetical protein  42.68 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0248  hypothetical protein  42.5 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.727714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0950  hypothetical protein  45.59 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0311  putative lipoprotein  41.98 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02511  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.441191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0433  hypothetical protein  39.77 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.4404e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>