14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5413 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5413  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  358  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911887  normal  0.141138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5271  hypothetical protein  98.86 
 
 		 175 aa  353  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5363  hypothetical protein  98.29 
 
 		 175 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5142  hypothetical protein  90.29 
 
 		 175 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5529  hypothetical protein  71.01 
 
 		 201 aa  255  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5078  hypothetical protein  70.41 
 
 		 173 aa  254  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5664  hypothetical protein  63.28 
 
 		 172 aa  221  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.821811  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4557  hypothetical protein  52.12 
 
 		 197 aa  189  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04350  hypothetical protein  46.62 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0398  hypothetical protein  35.96 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3569  hypothetical protein  34.12 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4187  hypothetical protein  32.42 
 
 		 185 aa  84.3  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.431269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2072  hypothetical protein  31.28 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0524  hypothetical protein  29.09 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>