13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5411 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5411  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5362  hypothetical protein  90.48 
 
 		 126 aa  235  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.303091  normal  0.949027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5270  hypothetical protein  89.68 
 
 		 126 aa  233  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5140  hypothetical protein  83.96 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5076  hypothetical protein  60 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5656  hypothetical protein  65.14 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5527  hypothetical protein  57.85 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29230  hypothetical protein  46.23 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73030  hypothetical protein  57.84 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6340  hypothetical protein  51.59 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3249  putative signal peptide protein  29.51 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3438  putative signal peptide protein  31.03 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4070  putative signal peptide protein  29.29 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0450708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>