12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5111 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5060  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1571 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4933  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1530 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5111  hypothetical protein  100 
 
 		 1559 aa  3143    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0405  hypothetical protein  46.53 
 
 		 1555 aa  1296    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.354945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1565 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5009  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1586 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4883  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1586 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.718638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3453  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1527 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1768  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1742 aa  104  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3707  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1743 aa  97.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0539  hypothetical protein  37.21 
 
 		 859 aa  63.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0266  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1830 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.639279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>