17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5088 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5038  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5088  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4912  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0426  lipoprotein  97.26 
 
 		 84 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67460  putative lipoprotein  80.72 
 
 		 85 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0355  putative lipoprotein  82.14 
 
 		 84 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5169  lipoprotein, putative  79.76 
 
 		 84 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0369  putative lipoprotein  79.76 
 
 		 84 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5841  putative lipoprotein  79.52 
 
 		 85 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45630  hypothetical protein  65.88 
 
 		 84 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0510  hypothetical protein  75.76 
 
 		 83 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2268  hypothetical protein  43.9 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0248  hypothetical protein  43.75 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.727714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0950  hypothetical protein  44.12 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0311  putative lipoprotein  39.51 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02511  hypothetical protein  38.57 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.441191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0433  hypothetical protein  40.91 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.4404e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>