13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3887 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3887  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1549  hypothetical protein  96.38 
 
 		 138 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4319  hypothetical protein  94.93 
 
 		 138 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.860691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3644  hypothetical protein  89.93 
 
 		 139 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1586  hypothetical protein  59.29 
 
 		 135 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3626  lipoprotein, putative  59.15 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3384  putative lipoprotein  58.33 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2782  hypothetical protein  45.11 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.981039  normal  0.95643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3843  putative lipoprotein  47.62 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45260  hypothetical protein  56.16 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30360  hypothetical protein  48.39 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3121  hypothetical protein  40.68 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310321  normal  0.0170994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1471  hypothetical protein  35.09 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>