15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2458 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2458  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  336  7e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2292  hypothetical protein  83.43 
 
 		 168 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2467  hypothetical protein  73.96 
 
 		 165 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.564543  normal  0.906023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1986  hypothetical protein  49.12 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0936785  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29110  hypothetical protein  37.85 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2415  putative prolin-rich transmembrane protein  34.51 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2584  putative prolin-rich transmembrane protein  36.51 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4707  hypothetical protein  40 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.813409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2304  hypothetical protein  45.83 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.221973  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1299  prolin-rich transmembrane protein  37.1 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.033846  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02976  prolin-rich transmembrane protein  31.3 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3883  hypothetical protein  38.24 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1337  hypothetical protein  27.53 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1579  hypothetical protein  30.77 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889797  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1438  hypothetical protein  35.85 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0365666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>