101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1472 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  436  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  87.74 
 
 		 208 aa  357  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  87.26 
 
 		 210 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  78.44 
 
 		 172 aa  278  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  74.85 
 
 		 177 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  73.62 
 
 		 177 aa  262  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  67.46 
 
 		 175 aa  254  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  63.01 
 
 		 175 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  49.1 
 
 		 176 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  49.11 
 
 		 169 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  48.52 
 
 		 169 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  47.34 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  50.9 
 
 		 168 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  51.83 
 
 		 185 aa  175  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  49.11 
 
 		 169 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  49.11 
 
 		 169 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  44.97 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  47.93 
 
 		 169 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  43.35 
 
 		 174 aa  171  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  49.1 
 
 		 169 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  49.1 
 
 		 169 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  49.1 
 
 		 169 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  49.1 
 
 		 169 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  47.34 
 
 		 169 aa  168  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  47.34 
 
 		 169 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  44.91 
 
 		 169 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  49.4 
 
 		 168 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  47.02 
 
 		 174 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  43.11 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  42.2 
 
 		 180 aa  164  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  46.11 
 
 		 169 aa  164  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  46.71 
 
 		 167 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  41.86 
 
 		 171 aa  161  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  46.39 
 
 		 177 aa  158  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  44.31 
 
 		 169 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  48.1 
 
 		 159 aa  154  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  44.38 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  45.06 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  42.95 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  41.99 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  49.62 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  45.91 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  33.16 
 
 		 197 aa  115  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  33.52 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  36.53 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  36.14 
 
 		 178 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  36.46 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  29.76 
 
 		 163 aa  95.9  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  37.9 
 
 		 171 aa  94.7  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  30.64 
 
 		 163 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  37.2 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  33.94 
 
 		 180 aa  92  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  32 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  28.95 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  28.81 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  38.24 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  30.49 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  34.86 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  28.68 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  28.66 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  28.66 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  31.03 
 
 		 178 aa  62  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  31.88 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  27.14 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  28.99 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  29.29 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  30.65 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  28.45 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  31.97 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  31.97 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  29.32 
 
 		 168 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  28.48 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  28.07 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  25.23 
 
 		 147 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  25.23 
 
 		 147 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  26.09 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  34.57 
 
 		 176 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  29.03 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  28.85 
 
 		 150 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  31.36 
 
 		 169 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  25.23 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  35.94 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  29.92 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  30.91 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  26.85 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  28.07 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  28.35 
 
 		 165 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  30.84 
 
 		 146 aa  45.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  26.32 
 
 		 151 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  29.73 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  28.71 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  32 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  28.44 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  29.82 
 
 		 162 aa  42  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  32.04 
 
 		 192 aa  42  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  28.12 
 
 		 218 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  28.12 
 
 		 218 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  28.44 
 
 		 160 aa  41.6  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>