9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0266 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0266  hypothetical protein  100 
 
 		 1830 aa  3743    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.639279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4544  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1844 aa  320  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1565 aa  67.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0539  hypothetical protein  26.38 
 
 		 859 aa  62.4  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5111  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1559 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0405  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1555 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.354945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5060  hypothetical protein  43.24 
 
 		 1571 aa  48.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3453  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1527 aa  48.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4933  hypothetical protein  41.89 
 
 		 1530 aa  46.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>